UPDATE sis_grupos 
SET permisos = JSON_SET(
    permisos,
    '$."ConfiguracionMecController.index"', 1,
    '$."ConfiguracionMecController.show"', 1,
    '$."ConfiguracionMecController.store"', 1,
    '$."ConfiguracionMecController.update"', 1,
    '$."ConfiguracionMetController.index"', 1,
    '$."ConfiguracionMetController.show"', 1,
    '$."ConfiguracionMetController.store"', 1,
    '$."ConfiguracionMetController.update"', 1,
    '$."TitulacionCertificacionController.index"', 1
)
WHERE id IN (1, 3, 5);